Как избежать двойной оплаты налога за одну операцию?

Здравствуйте! У нас ООО первое полугодие 2017г. находилось на УСН доходы минус расходы. Покупатель нас просил выделять НДС, мы это и делали, в с 01.07.2017г. мы перешли на ОСН, но в июне покупатель успел сделать предоплату. Налоговая просит чтобы мы оплатили УСН за эту предоплату, но как нам поступить чтобы за одни и те же операции не платить дважды?

По законодательству возможно перейти с УСН на ОСЕ в середине при особых условиях. Жду полноценный ответ на свой вопрос